制作一個長20米、重40噸的大型設備木箱，需要注意以下幾個關鍵點：

1. 堅固耐用：由于木箱的長度達到20米，且重量高達40噸，因此木箱的堅固性和耐用性至關重要。木材的選擇應優先考慮其承重能力和抗變形能力，確保在運輸過程中能夠抵御各種外力的沖擊和擠壓。

2. 抗震抗沖擊：大型設備在運輸過程中可能會遇到各種復雜的路況和天氣條件，因此木箱必須具備良好的抗震和抗沖擊能力。這需要在設計時考慮到木箱的結構強度和穩定性，以及在制作過程中使用適當的連接和加固方式。

3. 防潮防蟲：木材容易受潮和蟲蛀，因此木箱在制作過程中需要進行有效的防潮和防蟲處理。可以使用防潮劑、防腐劑等方法對木材進行預處理，同時也可以在木箱內部設置通風裝置，避免濕氣積聚。

4. 便于搬運和裝卸：由于木箱的尺寸和重量都很大，因此在設計時必須考慮到搬運和裝卸的便捷性。可以在木箱上設置吊裝點和搬運把手，方便使用叉車、吊車等設備進行裝卸操作。同時，也要考慮到木箱在堆放和運輸過程中的穩定性，避免發生倒塌或滑動等情況。

5. 安全鎖定和防護：為了確保大型設備在運輸過程中的安全，木箱應配備安全鎖定裝置，防止設備在運輸過程中移動或傾倒。同時，可以在木箱外部設置防盜封條或標識，以增加貨物的安全性。

6. 符合規范與標準：木箱的設計和制作需要遵循相關的運輸規范、標準和法律法規，確保木箱在運輸過程中符合各項要求，避免因不符合規定而導致的延誤或損失。

綜上所述，制作一個長20米、重40噸的大型設備木箱需要綜合考慮多個方面，確保木箱在運輸過程中能夠安全、穩定地保護設備不受損壞。